分析：此題主要考查的是生物的進化，可結合進化樹來作答．
解答：解：（1）種子植物可分為裸子植物和被子植物．植物⑤銀杏屬于裸子植物、植物⑥珙桐屬于被子植物．裸子植物的種子裸露著，沒有果皮包被，沒有真正的花，不結果．被子植物的種子的有果皮包被．因此，珙桐與銀杏相比較，主要區別是種子外面有無果皮包被．
（2）④揚子鱷是中國特有的一種鱷魚，是世界上體型最細小的鱷魚品種之一．它既是古老的，又是現在生存數量非常稀少、世界上瀕臨滅絕的爬行動物．在揚子鱷身上，至今還可以找到早先恐龍類爬行動物的許多特征．所以，人們稱揚子鱷為“活化石”．因此，揚子鱷對于人們研究古代爬行動物的興衰和研究古地質學和生物的進化，都有重要意義．我國已經把揚子鱷列為國家一類保護動物，嚴禁捕殺．
（3）在研究生物的進化的過程中，化石是重要的證據，越古老的地層中，形成化石的生物越簡單、低等、水生生物較多．越晚近的地層中，形成化石的生物越復雜、高等、陸生生物較多，因此證明生物進化的總體趨勢是從簡單到復雜，從低等到高等，從水生到陸生．其次生物在形成的最初，多是單細胞的，后來慢慢進化出多細胞的生物．
（4）A、生物分類的等級從大到小依次是：界、門、綱、目、科、屬、種．3和4的大小顛倒，不符合題意．
B、4鱷魚屬于爬行動物而不是兩棲動物，不符合題意．
C、銀杏屬于裸子植物，裸子植物屬于種子植物，種子植物屬于植物界，關系反了．不符合題意．
D、霉菌屬于多細胞真菌，真菌又分為多細胞真菌和單細胞真菌，真菌屬于微生物．符合題意．
故答案為：（1）（種子）沒有果皮包被
（2）④
（3）低等到高等
（4）D
點評：這部分知識是重點，在考試中經常出現，要注意熟練掌握和應用．
（2013?棲霞區二模）如圖（圖1）為生物“進化樹”示意圖，請據圖回答：
