分析：A、原子是化學變化中的最小微粒但原子利用其他方法可以再分；
B、氫原子無中子；
C、原子是由帶正電的原子核和核外帶負電的電子構成的，原子的質量主要集中在原子核上；
D、分子、原子、離子都能直接構成物質．
解答：解：A、原子是化學變化中的最小微粒但原子利用其他方法可以再分，故錯誤；
B、氫原子無中子，所以原子核都由質子、中子構成的說法是錯誤的；
C、原子是由帶正電的原子核和核外帶負電的電子構成的，原子的質量主要集中在原子核上，是因為電子的質量很小，可忽略，但并不是全部電荷和全部質量都集中在原子核里；錯誤；
D、分子、原子、離子都能直接構成物質；
故選D．
點評：明確原子的結構及各微粒之間的關系和構成物質的微粒是解答本題的關健
